«Манускрипт ниндзя» стал одним из самых влиятельных и культовых аниме 1990-х годов. Жестокий боевик про самураев вдохновил создателей «Матрицы» и даже трилогии приквелов «Звездных войн». Геймеры считают, что отсылки к «Манускрипту» можно найти даже в современных играх. Например, в двух недавних экшенах — For Honor и Sekiro: Shadows Die Twice. Ну а главного героя аниме можно увидеть и в популярном шоу «Что было дальше» — в качестве картины на фоне.